Crkve sv. Barbare se nalazi u sklopu Kninske tvrđave. Kninska tvrđava je najveća fortifikacijska utvrda u Dalmaciji, a njeni počeci datiraju još iz druge polovice 9. stoljeća. Današnji je izgled dobila početkom 18. stoljeća. Podijeljena je na gornji, srednji i donji grad, koji su međusobno povezani pokretnim mostovima. Crkva sv. Barbare je sagrađena isto u 18. stoljeću za vrijeme mletačke uprave.
Kompletna obnova crkve je započela 2021. godine, a sanacija kapilarne vlage se odnosi na cijelu crkvu.